قد تكون أسباب فشل المبيض المبكر مجهولة، كما أن هناك أسباب تزيد من فرص الإصابة، كالعوامل الوراثية وعوامل المناعة الذاتية أو التعرض لعلاجات السرطان.
تشعر النساء بالحيرة بين قصور المبيض المبكر وانقطاع الطمث لتشابه بعض أعراضهما، ولكن في حالة فشل المبيض تكون هناك فرصة للحمل عكس انقطاع الطمث.