الإفراط في شرب الشاي بالليمون يسبب حرقة المعدة، الأرق، تآكل الأسنان، فقدان الكالسيوم، وقد يزيد خطر حصوات الكلى. تناوله باعتدال.
يوفر الشاي بالليمون العديد من الفوائد الصحية، كما أنه يُعد مصدراً غنياً بوفرة من العناصر الغذائية، لذا ينصح بتناول كوب من الشاي بالليمون يومياً في الصباح أو قبل النوم.